ImportError: attempted relative import with no known parent package python

Всё работает.

1. В файлах указывать import и from без ведущих точек:

   from package2.ext import var

   а не

   from ..package2.ext import var

2. Вызывать нужно из папки ваш_проект вот такую команду:

   python -m package1.code

Можно путь к python указать полностью, типа usr/bin/python. Важно указать -m и точку . между package1 и code, а не /, и после code не писать .py.

Вот так:

путь_к_вашему_проекту> python -m package1.code